英文標題：Liver type 1 innate lymphoid cells develop locally via an interferon-g-dependent loop
發表期刊：Science
作者： 白璐、唐玲、Margaux Vienne、Yann Kerdiles 為共同第一作者，田志剛教授、彭慧教授、孫汭教授、Eric Vivier 教授為通訊作者
通訊作者所在單位： 中國科學技術大學
伯豪生物提供的產品或服務： 單細胞測序服務
田志剛院士團隊通過單細胞測序技術發現一類肝源免疫細胞 ILC1，ILC1 的發育依賴于 IFN- γ 的調控。該研究發現了免疫細胞髓外發育新途徑，為肝臟天然免疫的形成提供了重要的理論依據，同時證明了單細胞測序技術在基礎研究中越發重要的作用。
本研究發現由 ILC1s 產生的 IFN- γ 通過影響其原代細胞的增殖進而促進自身發育的過程。首先，與骨髓中存在 NK 祖細胞相比，肝臟中存在 ILC1 祖細胞與肝臟 IFN-γ ONILC1 原位優先作用是一致的。第二，IFN- γ 積極促進 silc-1(casps3) 的分化，因為 LSM 細胞表達 IFN- γ 受體，這種信號通路在這些細胞中是活躍的。這一發現得到了 scRNA-seq 數據的支持，該數據揭示了 IFN- γ 誘導的基因 [如干擾素調節因子 Irf1 和 Irf2、信號轉導子和轉錄激活子 1（Stat1）、Cd44 和 β - 2 微球蛋白（B2m）] 在這些細胞中表達。之后，IFN- γ 信號以 T -bet 依賴的方式促進 LSM 細胞的增殖和分化，而不是 ilc- 1 細胞的增殖和分化。然而，ILC1 分泌的 IFN- γ 促進 ILC1 的分化，而 cNK 細胞分泌的 IFN- γ 不支持 ILC1 分化的這一觀點仍有待確定。
本研究揭示了外周造血干細胞對特異性免疫細胞起源的貢獻以及肝臟內獨特的區域免疫特征，擴展了我們對髓外造血及淋巴細胞來源的認識。
本研究中單細胞測序相關研究結果
Fig. 1. scRNAseq analysis of liver LSM cells and Lin?CD122+CD49a+ cells.
Fig. 2. LSM cells expressed IFN-γ-stimulated genes. Feature plots of relative levels of Ifngr1, Ifngr2, Irf1, Irf2, Cd44, Stat1, and B2m expressions on sorted LSM cells using scRNAseq analysis.
單細胞測序不僅能夠在研究的開始階段增加學者們對生命進程的認知與理解，同樣重要的是，在實驗階段，單細胞測序取得的數據相比于傳統的實驗更具有說服力。伯豪生物愿與您共同探索生命的奧秘。
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