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WGCNA

Demo 結(jié)果

Demo 結(jié)果 1

結(jié)果解讀

基于加權(quán)共表達(dá)的計(jì)算,利用平均層次聚類的模塊的劃分,模塊與性狀之間的相關(guān)性,挑選出顯著性的性狀,構(gòu)建相應(yīng)網(wǎng)絡(luò)圖,從而找到與性狀相關(guān)的核心基因。

加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)

尋找協(xié)同表達(dá)的基因模塊(module),并探索基因網(wǎng)絡(luò)與關(guān)注的表型之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系,以及網(wǎng)絡(luò)中的核心基因。

分析要求

樣本數(shù)量在 3 組以上,并且每組的樣本重復(fù)為 3 個(gè)或 3 個(gè)以上。

提供結(jié)果

1、圖片文件:cluster tree,module relation 等;

2、文本文件:每個(gè) module 的所屬基因,以及基因之間的相關(guān)性;

3、module 之間的相關(guān)性。

-END-


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