国产精品网红尤物福利在线观看_欧美经典一区二区_辽宁老熟女高潮狂叫视频_日日草日日干_成人免费观看毛片_久久激情免费视频

伯豪生物
甲基化測序(EM-seq)
 電子資料  調研問卷

技術背景

人類基因組測序開展的數十年以來,研究人員建立了遺傳因素與許多 Jí 病之間的聯系。但是,編碼 基因組 DNA 的核苷酸只是遺傳因素中影響細胞功能和整體健康的一部分,表觀遺傳學(指在某些情況下 不修改 DNA 序列而發生的可遺傳的改變)也具有重要功能。DNA 甲基化是一種已經過大量研究的表觀遺傳學標記,其可化學修飾胞嘧啶和腺嘌呤。胞嘧啶甲基化常發生在基因組中的 CG 序列,稱為 CpG 位點,它以細胞特異性的方式廣泛地調控基因表達。全基因組關聯研究 (GWAS) 將 DNA 甲基化的改變與復雜病例如癌癥和肥胖以及復雜的生物學狀態例如衰老和發育聯系起來 [1,2]。近年來甲基化測序已擴展到基因表達之外,開始在 Jí 病診斷中獲得關注 [1,3-5]。近期研究表明差異甲基化是癌癥檢 Cè 中信息豐富且 靈敏的標記,不論甲基化是否與基因表達相關 [6]

目前,DNA 甲基化在癌癥液體活檢(如 cfDNA)中已經有很多相關研究,并受到越來越多的關注。常 見的 DNA 甲基化研究手段都是基于亞硫酸氫鹽(化學試劑)的轉化,這種方法很劇烈,對 DNA 損傷嚴重,對 DNA 起始量有著較高要求。而血液 cfDNA 的含量通常很低,只有幾十 ng,普通的亞硫酸氫鹽測序手段很難滿足。因此伯豪生物引進 EM-seq(Enzymatic methyl sequencing),該技術基于酶學溫和轉化,可實 現 DNA 甲基化位點的單堿基分辨率,適用于癌癥早篩液體活檢樣本的標志物研究(如:血漿 cfDNA,尿液 cfDNA,腦脊液 cfDNA 等)也適用于研究細胞分化的單個細胞超微量樣本(如:卵母細胞,精母細胞,胚胎等)。EM-seq 提供了穩健的全流程完整解決方案,用于識別人類基因組中的甲基化區域。文庫制備過程 中,采用獨特的酶促轉化,它對脫氧核糖核酸(DNA) 的損害小得多,需要的樣本輸入更少,從而獲得更高 質量、性能更好的文庫。Twist 自定義甲基化探針組合設計為 CpG 檢  Cè  提供了有效特別的探針,用于靶向富集。優化的雜交試劑增加了工作流程的時間靈活性,并提高了中靶率。甲基化測序涉及酶或化學方法,這些方法可使未甲基化的胞嘧啶通過一系列反應,通過脫氨基 轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶則 保持完整(圖 1)。在擴增過程中,尿嘧啶對應的互補鏈上會互補配對加上腺嘌呤,造成未甲基化的胞嘧啶的原始位置引入胸腺嘧啶。如圖所示序列終產物是不對稱的,轉化后形 成兩條不同的雙鏈 DNA 分子(圖上);對于甲基化的 DNA,同樣的過程則產生另外不同序列(圖下)。

111 (2)

▲圖 1

技術參數

產品優勢

1、酶轉化 Zuì大限度降低 DNA 損壞,超低 DNA 起始量要求,低至 10ng;

2、卓越的比對率,GC 均一性;

3、高靈敏度,分辨率可達到單個堿基;

4、相比亞硫酸氫鹽方法檢 Cè  可多檢  Cè 15% 的甲基化位點;

5、靈活適用不同靶向區域。


目錄化產品

人(hg38)的 134Mb 設計長度(覆蓋約 400 萬 CpG 位點),基于新的 UCSC, Ensembl, ENCODE 等新的數據庫,關注那些已知甲基化可影響基因調節的區域:57% CpG open seas (interCGI), 21% CpG island shores, 15% CpG islands, 8% CpG island shelves。

實驗流程

991
實驗原理

992


▲圖。EM-seq 轉化涉及一系列酶反應,以識別未甲基化胞嘧啶。

在 Dì 一次反應期 間,10-11 易位雙加氧酶 2(TET2) 將甲基 化胞嘧啶(5mC 和 5hmC)轉化為 5 - 羧基 胞嘧啶(5caC) 以及氧化增強劑葡糖苷 酸 5hmC(5ghmC)。這些反應保護 5mC 和 5hmC 免受下游脫氨作用。然后,在 APOBEC 將胞嘧啶脫氨至尿嘧啶之前, 使 DNA 變性。隨后的聚合酶鏈式反應 (PCR) 擴增將修飾的 5mC 或 5hmC 轉化 為胞嘧啶,并將尿嘧啶轉化為胸腺嘧啶。PCR 后,核酸序列與重亞硫酸鹽轉化的 序列一致,使得 EM-seq 與現有分析流程 (如 Bismark 和 bwa-meth)相兼容。

酶法的高效轉化

  指標   末甲基化 Lambda DNA CpG 甲基化 pUC19 DNA
預期轉化效率  ≥99.5% ≥99.5%
實測轉化效率   99.77% 99.57%
預期 CpG 甲基化水平   約 0.5% 95-98%
實測 CpG 甲基化水平  0.22228% 95.7572%

993

在 EM-seq 和 BS-seq 中,酶和亞硫酸氫鹽都是將未甲基化的胞嘧啶轉化為胸腺嘧啶,且轉化效率接近。選擇 CpG 甲基化的 pUC19 DNA 和未甲基化的 Lambda DNA 這種已知甲基化 DNA 作為質控對象,結果顯示,兩種文庫轉換方法的轉化率均達到 99.5%,以胞嘧啶在非 CpG 位點轉化為胸腺嘧啶的百分比來測量。

樣本要求

樣本要求


分析流程

996

平臺比較

997

結果展示

881

882

參考文獻

1、Jones PA. Functions of DNA methylation: islands, start sites, gene bodies and beyond. Nat Rev Genet 2012; 13: 484-492.

2、Yang X, Shao X, Gao L, Zhang S. Comparative DNA methylation analysis to decipher common and cell type-specifific patterns among multiple cell types. Brief Funct Genomics 2016; 15: 399-407. 

3、Loh M, Zhou L, Ng HK, Chambers JC. Epigenetic disturbances in obesity and diabetes: Epidemiological and functional insights. Mol Metab 2019; 27S: S33-S41. 

4、Ferrucci L, Gonzalez-Freire M, Fabbri E et al. Measuring biological aging in humans: A quest. Aging Cell 2020; 19: e13080. 

5、Perez RF, Santamarina P, Tejedor JR et al. Longitudinal genome-wide DNA methylation analysis uncovers persistent early-life DNA methylation changes. J Transl Med 2019; 17: 15. 

6、Locke WJ, Guanzon D, Ma C et al. DNA Methylation Cancer Biomarkers: Translation to the Clinic. Front Genet 2019; 10: 1150. 

7、Liu MC, Oxnard GR, Klein EA et al. Sensitive and specifific multi-cancer detection and localization using methylation signatures in cell-free DNA. Ann Oncol2020; 21: 745-759.

8、Vaisvila R, Ponnaluri VKC, Sun Z et al. Enzymatic methyl sequencing detects DNA methylation at single-base resolution from picograms of DNA. Genome Res 2021.



在線客服
登錄/注冊
在線留言
返回頂部
主站蜘蛛池模板: 午夜大片免费看_99在线精品视频播放免费观看_国产精品香蕉在线的人_丰满熟女人妻一区二区三_日韩视频在线观看免费视频_翘臀少妇被扒开屁股日出水爆乳 | 亚洲AV福利天堂一区二区三_免费看中国毛片_久操视频网_手机永久无码国产AV毛片_国产欧美一区二区视频_制服丝袜中文字幕第一页 | seseav在线_日本337p_国产成人精品一区二区三区福利_国产97成人亚洲综合在线_成人在线视频精品_欧美高清dvd | 无码午夜成人1000部免费视频_日本丰满妇人成熟免费中文字幕_久久99免费_嫩草成人www欧美_狠狠色狠狠爱综合蜜芽五月_久久日韩精品一区二区五区 | 久久久免费毛片_色先锋资源久久综合5566_91视频久久_国产精品自拍99_一级毛片欧美真人视频_亚洲欧美日韩中文无线码 九九热综合_亚洲综合精品成人_欧美a在线视频_国产性色AV内射白浆肛交后入_日皮免费视频_亚洲国产欧美另类 | 97久久草草超级碰碰碰_beeg最新版欧美_亚洲天堂色婷婷_亚洲性无码av在线_综合在线观看_久久久噜噜噜久久狠狠50岁 | 国产婷婷色一区二区三区_国产免费看片_97毛片_成人性生爱a∨_麻豆免费在线观看视频_国产亚洲精品久久久久久牛牛 | 欧美精品亚洲精品日韩专区一乛方_国产精品无码AV不卡顿_性8sex8春暖花开亚洲地址_国产精品成人99一区无码_免费日韩一区二区_999国产精品视频一区 | 国产精品美女一区二区视频_少妇高潮惨叫喷水正在播放_国产视频a_欧美一区二区精品在线_99精品无人区乱码在线观看_8888四色奇米在线观看 | 亚洲成年影院_超碰100在线_国内精品伊人久久久久网站_亚洲国产中文字幕在线_一级做a爰片毛片视频_久久99精品久久久久久齐齐 | 日本BBWW高潮BBWR_免费无码的av片在线观看_国产精品久久久久这里只有精品_在线免费精品_加勒比一区二区无码视频在线_久久ZYZ资源站无码中文动漫 | 日本丰满熟妇videossex一_亚洲国产精品91_99re亚洲无码高清_国产午夜无码精品免费看动漫_91草逼视频_成人国内精品久久久久一区 | 熟女系列丰满熟妇AV_免费观看黄视频_久久99性xxx老妇胖精品_国产一区在线观看麻豆_特级做爰图片_日本高清色视频在线播放 | 国产精品VA尤物在线观看蜜芽_国产人成在线观看_国产无遮挡免费真人视频在线观看_青草视频久久_国产亚洲精品久久久久婷婷瑜伽_亚洲AV无码男人的天堂 | 国产精无久久久久久久免费_欧美在线一级片_手机看免费毛片的网站_九色av网站_亚洲国产AV玩弄放荡人妇系列_久久久人成影片一区二区三区 | 91成人综合_最近在线更新中文字幕3_精品久久免费视频_麻豆成人在线观看_亚洲自偷自拍另类11P_性欧美video高清丰满 | 欧美黄色录相_局内人在线_国产无遮挡又黄又爽免费网站_国一区二区在线观看_日韩激情毛片_视频一区二区三区中文字幕 | 熟妇高潮精品一区二区三区_色妞视频男女视频_欧美人与动性XXXXX杂性_久久99一区_亚洲男男自慰网站gay_免费看黄色片网站 | 日本a一级片_精品第一国产综合精品aⅴ_中文字幕日本三级_欧美图片一区二区三区_欧美大喷水吹潮视频十大_国产精品 | 922tv视频在线观看_99久久婷婷国产综合精品_欧美大片a级毛片_免费毛片黄色视频_久久99精品热在线观看_国产精品福利91 | 亚洲国产成人资源在线软件_草女人视频_亚洲一区AV无码专区在线观看_三级在线观看_色偷偷国色天香在线观看免费视频_久久国语视频对白 | 日本一本二本视频_中文字幕第69页_日本护士xxxxhd少妇_久久国产视频一区二区_无毒三级网站_日韩片在线观看 | 久久先锋影音av鲁色资源_kisskisskiss三季在线播放_欧日韩在线观看_国产精品第55页_在线观看斗破苍穹_精选一区 | 日韩欧美在线一区_成人男女网24免费_欧美顶级少妇做爰_国产精品久久国产精品_一级特黄_91麻豆国产自产在线观看hd | 日本三级排行榜_乱子伦xxxx无码_日本无人区码卡二卡三卡_天堂中文在线WWW天堂在线_韩国一区在线_天堂资源官网在线资源 | 免费看毛片基地_欧美激情一区二区在线_欧美精品国产一区二区_男人天堂影院WWW94_精品久久久久中文字幕小说_狠狠干女人 | 精品二三区_97国产免费_中文字幕爱爱_日本一道综合久久aⅴ免费_香蕉AV福利精品导航_人人澡人人妻人人爽人人蜜桃麻豆 | 久草综合在线_18久久_天天爽人人爽_成人天天看_老司机亚洲精品影视www_福利在线国产 | 国产中文自拍_国产在线观看WWW污污污_久久成人资源_337P日本大胆欧洲亚洲色噜噜_国产成人亚洲综合无码品善网_国产一本二本三区区别大道 | 国产成人精品久久久_欧洲无线一线二线三线区别大吗_欧美综合天天夜夜久久_亚洲乱码国产乱码精品天美传媒_国产精品久久亚洲不卡_深夜久久久 | 6080午夜三级中文在线观看_思热99re视热频这里只精品_中文字幕在线观看一区二区三区_亚洲第九十七页_黑人白浆_伊人久久影视 | 91精品国产99久久久久久久_欧美一区两区_人人射在线观看_99国产亚洲精品美女久久久久_亚洲xxxxx高清_性欧美疯狂XXXXBBBB | 日本精品在线免费观看网址_亚州国产AV一区二区三区伊在_91视频看片_久久人妻无码一区二区三区AV_国产爽的冒白浆的视频_狠狠躁夜夜躁人人爽天天30人 曰欧一片内射vα在线影院_少妇和教练在车里激情_精品视频久久久久_国产又黄又爽无遮挡不要VIP_久久久久亚洲AV无码专区网站_精品久久97 | 91成人免费视频观看_色综合99久久久无码国产精品_天天宗合网_全亚洲第一av番号网站_久久午夜无码鲁丝片午夜精品_国产男女爱猛视频在线 | 日本久久黄色_无码AV中文字幕久久专区_日本精品啪啪一区二区三区_青青草自拍偷拍视频_美女视频久久黄_日www | 亚洲精品无吗_一本色道久久综合一_中文字幕精品一区二区三区在线_中文字幕亚洲天堂_无码专区—va亚洲v天堂麻豆_偷拍视频免费看 | 四虎视频在线精品免费网址_青草青草久热国产精品_免费在线亚洲_www一片黄_最色www_国产女上位疯狂榨精合集 | 成年女人免费v片_国产精品免费高清_日本高清一区二区三区四区_第一福利社区1024_中国黄色软件_国产视频久久久 | 伊人国产在线_蜜桃视频在线观看www社区_欧美亚州国产_99成人在线_亚洲AV久久爆乳一区二区_免费无码又爽又刺激A片软件男男 | 亚洲精品自产拍在线观看动漫_狠狠人妻久久久久久综合蜜桃_精品无码成人久久久久久_黄色毛片视频_亚洲作爱网_亚洲成人看片 | 18禁裸男晨勃露J毛免费观看_国产成a人亚洲精品无码久久_91小视频在线观看_亚洲区精品视频_国产XXXX做受性欧美88_欧美一级特级 |