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上游調(diào)控分析

Demo 結(jié)果

圖中表達(dá)預(yù)測差異基因的上游的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子

結(jié)果解讀

通過差異基因的表達(dá)情況以及基因之間的關(guān)系,從而預(yù)測差異基因的上游的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子。


上游調(diào)控分析介紹

IPA 從基因上游調(diào)控出發(fā),篩選出基因的上游調(diào)控因子,并預(yù)測上游調(diào)控因子與對應(yīng)基因的激活與抑制調(diào)控情況。

分析要求

1、差異 mRNA 或者關(guān)注的 mRNA 基因集;

2、物種限于人,大鼠,小鼠;

3、每個基因有對應(yīng)的差異倍數(shù)。

提供結(jié)果

1、圖片格式:轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控基因網(wǎng)絡(luò)圖;

2、文本格式:轉(zhuǎn)錄與調(diào)控基因之間的關(guān)系;并且調(diào)控能力的評分。

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